A Škoda cég elődét Valdštejn – Vartenberk alapította, cukorgyári, sörgyári gépeket, gőzgépeket, hídkonstrukciókat és egyéb vasúti berendezéseket gyártott. 1889-ben a vállalatot Emil Škoda vette meg, aki a cég főmérnöke volt. Škoda kibővítette a vállalatot, és modern öntvény alkatrészeket kezdett gyártani hadihajók és személyszállító hajók részére. A pilzeni gyár tömegközlekedési-, elektrotechnikai eszközökre és fegyvergyártásra szakosodott. Az Osztrák–Magyar Monarchia vezető cégévé vált, és remek minőségű fegyverekkel látta el a Monarchia, majd később Csehszlovákia katonaságát. A Škoda 1911 óta volt kapcsolatban a Václav Laurin és Václav Klement által alapított, először kerékpár és motor, majd személygépkocsi gyártó cégével a L&K-el. 1925 – ben összeforrt a Škoda céggel. 1923. december 15-én jegyzik be a "Szárnyaló Nyilat", mint márkavédjegyet.
A II. világháború változásokat hozott a gyár termelésében. Elkezdtek új teherjárműveket gyártani a frontok megsegítésére. A német megszállás alatt a gyárban haditermelés folyt. Az 1945 áprilisi bombázáskor nagy károk keletkeztek a cégben és elvesztette a külföldi megrendelőket. 1948-ban, a kommunista hatalomátvételt követően államosították a gyárat. Az ASAP-ot átalakítják; megszületik az AZNP (Automobilové závody národní podnik). A gyár még sokáig "megélt" a háború előtti technikából; a Jawa motorkerékpár, Tatra teherautó és a Zetor traktor fogalom maradt. A cég privatizációja a 1989-től 1992-ig tartott. A személyautókat gyártó részleget, az AZNP-t 1991. március 28-án vette át a Volkswagen. 2000-ben alakul meg a Škoda Holding. 2003 – tól a holding 100% tulajdonosa az Appian Group.